要高效通关元气骑士的守护神殿模式，关键在于理解其作为塔防玩法融合角色成长的核心机制，并制定严谨的策略，前期的准备工作与资源规划尤为重要。守护神殿需要玩家在抵挡一波波敌人进攻的间隙，探索并清理据点以获取资源，最终目标是保护中央的魔法石并击败后期出现的强大BOSS。成功的策略通常围绕构建强力的主武器、合理选择并升级防御塔，以及优化角色的成长路径来展开。
选择合适的角色和搭配核心装备是奠定胜利的基础，部分角色的技能能显著提升生存或建设效率。在武器选择上，应优先考虑那些在强化到高等级后能提供稳定高效范围伤害或生存能力的选项，一把强力的主武器是整个通关流程的保障。初始武器进入游戏时不应跳过剧情动画，以确保获得初始的等级加成。通过击败据点怪物获取经验球提升角色等级，并在祭司处选择提升输出的天赋至关重要。
防御塔的建造与升级是塔防环节的核心，其布局应以保护魔法石和辅助玩家输出为原则。资源有限的星币应被明智地投入到具有关键功能的炮台上，例如兼具修复与回血功能的维修站、补充能量的装置以及能清理弹幕的空军基地。需在后期高难度下，炮台容易被密集弹幕快速摧毁，因此不必过度投资于攻击型炮台，而应更注重功能性和生存性建筑的搭配。
路线规划和优先目标决定了发展速度。进入地图后，应尽快探索并打通各个据点以获取星币和经验，但需要根据区域难度调整顺序。地图上通常会有被困在笼子里的关键NPC，解救他们能解锁武器升级或购买防御塔等服务，这是需要优先完成的任务。通常在清理完早期几个区域的据点后，角色等级和武器强度便能应对中期的敌人攻势。
资源管理贯穿整个游戏过程，需要对金币、星币和经验进行合理分配。击败怪物和清理据点房间是获取这些资源的主要方式。金币应优先用于在工匠处将主武器强化至最高等级，这是提升输出的最有效途径。星币则主要用于建造和升级之前提到的关键防御塔。经验值用于角色升级，每次升级时选择的天赋应倾向于增强武器伤害、蓄力速度或提供防御性效果。
最终阶段的挑战指向强大的BOSS外星母舰，对抗它需要特定的策略和充足的准备。这个BOSS分为两个阶段，第一阶段需要首先摧毁其四个炮台，第二阶段才能直接攻击本体造成伤害。在战斗前，确保已将主武器强化至满级，并携带可以提供生存保障的副武器。在战斗中保持移动，利用场景左下角等位置进行输出，并注意观察和规避BOSS的全屏弹幕攻击模式。
